El Laboratorio de Patología  tiene como propósito general el estudio integral, macro y microscópico de fragmentos de tejido u órganos (biopsias), obtenidos a través de estudios endoscópicos o quirúrgicos convencionales. Lo que ayuda a la obtención de diagnósticos histopatológicos definitivos, que permiten a los médicos tratantes (cirujanos, internistas, endoscopistas etc.), realizar tratamientos racionales de las diferentes enfermedades.

En el laboratorio de patología, también se realizan estudios citológicos, diagnósticos de células obtenidas por exfoliación, raspado de la superficie epitelial de órganos, (ejemplo - citología cervico-vaginal) líquidos, (pleural, abdominal, orina) o secreciones (mamaria, expectoración).  

Tambien se puede realizar una biopsia por aspiración, en la que se utiliza una técnica mixta, para obtener microfragmentos de tejido y/o células aisladas y en grupos. A través de la punción, y aspiración con aguja y jeringa, de órganos con lesiones (nódulo tiroideo, mamario etc.), se puede obtener un diagnóstico sin realizar cirugía convencional. 

Otra de las funciones del laboratorio de patología, es realizar estudios inmunohisto-químicos, que permiten obtener diagnósticos diferenciales, entre entidades patológicas, que son muy parecidas macro y microscópicamente, así como:

• Analizar el perfil hormonal de algunos tumores malignos (presencia o ausencia de receptores estrogénicos y de progesterona en canceres mamarios)
• Porcentaje de células en fase de crecimiento
• Análisis de la presencia o ausencia de determinadas moléculas en el genoma (ADN), que permiten predecir la conducta biológica de algunos tumores malignos. (Oncogenes, genes supresores como el p-53, her-2/nev, etc.).